Önceliği Türkiye’nin karst su kaynakları ve karst olgusuna vermek üzere ülkenin su kaynaklarının oluşumunun anlaşılması, araştırılması ve korunarak kullanıma sunulması ile su kaynaklarına ilişkin mühendislik ve çevresel sorunların çözümüne yönelik programlar geliştirerek, araştırmaları ve ilgili diğer etkinlikleri yürütmek, düzenlemek ve teşvik etmek.
Karstik alanlar öncelikli olmak üzere su kaynaklarına ilişkin problemlerin çözümüne yönelik olarak araştırma eğitim ve uygulamanın bir araya getirildiği programları ile ulusal düzeyde mükemmeliyet merkezi/uluslararası düzeyde tanınmış araştırma merkezi kimliğini geliştirerek sürdürmek.